Microbiología Marina
(Curso Académico 2018 - 2019)

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• CG1 - Conocer científicamente la estructura y función de los ecosistemas marinos, de los factores que potencialmente pueden afectarlos y de las técnicas de detección, evaluación, prevención y corrección de los impactos generados en el medio.
• CG2 - Adquirir capacidades para aplicar e integrar conocimientos científicos amplios y multidisciplinares de la biodiversidad, conservación y gestión del medio marino.
• CG3 - Adquirir capacidades prácticas específicas en el campo de la biodiversidad marina y conservación (por ejemplo, diseñar un plan de muestreo o evaluar un impacto ambiental), que permitan la resolución de problemas en entornos tanto conocidos como nuevos, enfrentarse a la complejidad de problemas multidisciplinares y formular juicios a partir de información fragmentaria, incompleta o limitada.
• CG4 - Adquirir conocimientos sobre diversas actividades y su impacto en relación al desarrollo sostenible del medio marino, que permitirán el desarrollo de la capacidad para hacer reflexiones sobre las implicaciones sociales o éticas vinculadas a las decisiones que deben tomar sobre la evaluación del impacto de las actividades humanas sobre el ecosistema costero.
• CG5 - Adquirir capacidades de acceder de forma autónoma a la literatura científica y a bases de datos existentes. Estas capacidades están íntimamente relacionadas con la adquisición de competencias para procesar la información y para generar nueva información de calidad y hacerla accesible a resto de la comunidad científica y a los responsables de tomar decisiones.
• CG6 - Adquirir capacidades para ocupar un trabajo como científico marino.
• CG7 - Adquirir capacidades para comunicar sus conocimientos y los resultados de su trabajo investigador a especialistas y no especialistas.
• CG8 - Adquirir en el futuro nuevos conocimientos y aprender nuevas técnicas de manera autónoma.
• CG9 - Adquirir capacidades de trabajar en equipo.

• OPT2 - Capacidad para identificar agentes biológicos patógenos y sus productos tóxicos, y controlar enfermedades
  en acuicultura y pesca
  
• OPT3 - Capacidad para comprender los procesos de producción, transformación, control y conservación de
  alimentos marinos
• OPT4 - Capacidad para identificar y controlar agentes biológicos que afectan a la conservación de toda clase de
  materiales y productos marinos.
  

• CB6 - Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación.
• CB7 - Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
• CB8 - Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
• CB9 - Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones ¿y los conocimientos y razones últimas que las sustentan¿ a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
• CB10 - Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.

Clases de teoría
Profesor: José Manuel González Hernández

Tema 1. Los microorganismos en el ambiente marino. Aspectos históricos. Estructura microbiana de los ecosistemas marinos. Importancia de los microorganismos en los procesos de la biosfera y métodos de estudio. (1 hr)
Tema 2. Muestreo y experimentación. Métodos de microscopía. Métodos de cultivo. Diversidad de microorganismos cultivables y no cultivables. Detección de actividades microbianas. Introducción a las técnicas moleculares. (1 hr)
Tema 3. Bacterias y Arqueas. Diversidad de metabolismos, fisiologías y adaptaciones al medio marino. Virus en los océanos y su papel funcional. (3 hr)
Tema 4. Microorganismos eucariotas marinos. Principales grupos tróficos. Diversidad de eucariotas no cultivables. (1 hr)
Tema 5. Interacciones de los microorganismos con otros seres vivos. Interacciones y ciclo de los elementos, el caso de la cianobacteria UCYN-A. Otros tipos de interacciones. Simbiontes en fuentes hidrotermales submarinas. (2 hr)
Tema 6. Microorganismos y ciclos biogeoquímicos. Relaciones de los microorganismos con los ciclos de los elementos. Respiración de nitrato, nitrificación, proceso anammox. Oxidación de azufre inorgánico y de CO. (3 hr)
Tema 7. Contaminación, eutrofización, mareas rojas. Potencial biotecnológico de los microorganismos marinos. Degradación de compuestos derivados del petróleo. (1 hr)
Tema 8. Perspectivas genómicas en oceanografía microbiana. Análisis de genomas de microorganismos marinos. Metagenómica y metatranscriptómica. (1 hr)

Clases de prácticas
Profesor: José Manuel González Hernández

Práctica 1. Efecto de la luz en el crecimiento en bacterias con rodopsina. (3 hr)
Práctica 2. Oxidación de compuestos de azufre. (1 hr)
Práctica 3. Determinación de la actividad microbiana. Demanda biológica de oxígeno. Degradación de compuestos derivados del petróleo. (1 hr)
Práctica 4. Análisis de pigmentos en bacterias fotosintéticas. (1 hr)
Práctica 5. Microscopía de epifluorescencia. (1 hr)
Práctica 6. Descripción de comunidades del bacterioplancton por medio de técnicas moleculares. (3 hr)
 

Texto del material de las clases y de la bibliografía en inglés.

La lección magistral permitirá al profesor desarrollar los contenidos teóricos y la resolución de problemas o ejercicios. Las clases prácticas (laboratorios y aplicaciónes de informática) servirán para la adquisición de habilidades prácticas y complementan los contenidos teóricos-prácticos. Todas las tareas del alumno (estudio, trabajos en grupo, exposiciones, ejercicios individuales, prácticas…) serán orientadas por el profesor en las distintas sesiones. Con respecto a la tutoría, se atenderá a los estudiantes para discutir cuestiones concretas en relación con sus tareas o para tratar de resolver cualquier otra dificultad del alumno o grupo de alumnos relacionada con la asignatura.

Actividades formativas	Horas presenciales	Horas de trabajo autónomo	Total horas	Relación con competencias
Clases teóricas	13,00	0,00	13,0	[CB8], [CB10], [CG1], [CG2], [CG4], [CG6], [OPT2], [OPT3], [OPT4]
Clases prácticas (aula / sala de demostraciones / prácticas laboratorio)	12,00	0,00	12,0	[CG3], [CG4], [CG6]
Realización de seminarios u otras actividades complementarias	1,00	1,00	2,0	[CB10], [CG5]
Estudio/preparación de clases teóricas	0,00	20,00	20,0	[CB10], [CG5]
Estudio/preparación de clases prácticas	0,00	5,00	5,0	[CG6], [CG9]
Preparación de exámenes	0,00	5,00	5,0	[CB10]
Realización de exámenes	2,00	0,00	2,0	[CB7], [CB9]
Asistencia a tutorías	1,00	1,00	2,0	[CB7], [CB8]
Realización de trabajos (individual/grupal)	1,00	13,00	14,0	[CB6], [CB7], [CB9], [CG7], [CG8], [CG9]
Total horas	30.0	45.0	75.0
Total ECTS			3,00

http://absysnetweb.bbtk.ull.es/cgi-bin/abnetopac?TITN=568496
http://absysnetweb.bbtk.ull.es/cgi-bin/abnetopac?TITN=523931
 

http://absysnetweb.bbtk.ull.es/cgi-bin/abnetopac?TITN=524080
 

Evaluación de la asignatura
En cualquier de las tres convocatorias, las pruebas de respuesta corta contribuyen con el 60% de la calificación final. Los alumnos deben superar este examen con una calificación mínima de 5 sobre 10 para poder superar la asignatura.
Con respecto a las demás pruebas la valoración de la destreza técnica desarrollada en el laboratorio se llevará a cabo por medio del seguimiento durante las prácticas y cuestionarios posteriores a través del aula virtual. En esta convocatoria, se evaluará, además, la preparación de un trabajo en grupos de 2-3 alumnos que han elaborado con el apoyo del profesor y que defenderán durante 30 minutos. Ejercicios en el aula virtual durante el desarrollo de las clases, además de la asistencia y participación, también contribuyen a la evaluación tal como está descrito en la tabla "Estrategia evaluativa". Sin embargo, se podrá mejorar, si el alumno así lo decide, cualquiera de estas pruebas de evaluación continua en algunas de las tres convocatorias. Se deberá notificar al profesor con un mínimo de 10 días en caso de que el alumno decida presentarse a la evaluación alternativa. 
Evaluación alternativa
La prueba para la valoración de los trabajos y proyectos se llevará a cabo por medio de la exposición individual durante 30 minutos de un trabajo preparado por el alumno. El tema del trabajo será distinto al de los expuestos durante el curso. Esta prueba supondrá el 20% de la nota final. El resto de actividades se evaluarán por medio de un examen escrito de respuesta corta y equivaldrá al 10% de la nota final restante. Esta última prueba incluirá preguntas sobre los contenidos desarrollados en las sesiones de prácticas de laboratorio y del aula de informática, así como en seminarios y exposiciones que se realizaron a lo largo del curso. El alumnado tendrá acceso al material necesario.

Tipo de prueba	Competencias	Criterios	Ponderación
Pruebas de respuesta corta	[CB8], [CG1], [CG2], [CG5], [CG6], [CG7]	La evaluación se basará en un examen final con preguntas de respuesta corta. Los alumnos deben superar este examen con una calificación mínima de 5 sobre 10 para poder superar la asignatura.	60 %
Trabajos y proyectos	[CB6], [CB7], [CB9], [CB10], [CG5], [CG6], [CG7], [CG8], [CG9]	Exposición de un trabajo realizado por grupos de alumnos.	20 %
Pruebas de ejecuciones de tareas reales y/o simuladas	[CG3], [CG4], [OPT2], [OPT3], [OPT4]	Destreza técnica desarrollada en el laboratorio, en los ejercicios del aula virtual y en el aula de informática.	6 %
Portafolios	[CB6], [CB7], [CB10], [CG3], [CG5], [CG8]	Seguimiento mediante pruebas cortas al finalizar cada una de las clases.	10 %
Asistencia y participación	[CG7]	Asistencia y participación regular a todas las actividades de la asignatura.	4 %

En las primeras clases presenciales, se les introduce en aspectos básicos de la microbiología marina y desarrollo histórico. Le siguen los métodos de estudio. Los siguientes bloques incluyen la biología y biogeoquímica de los microorganismos marinos. En el siguiente bloque de lecciones se tratará algunos ejemplos concretos de las aplicaciones biotecnológicas. El último bloque se centra en las últimas técnicas para el estudio de las comunidades del bacterioplancton. Las clases prácticas estarán coordinadas con el resto de actividades.
 

Semana	Temas	Actividades de enseñanza aprendizaje	Horas de trabajo presencial	Horas de trabajo autónomo	Total
Semana 11:	Temas 1-2. Prácticas 1-3.	Explicar temas. Ejercicios en el aula virtual sobre los temas y las prácticas. Discusión de los ejercicios.	7.50	8.00	15.50
Semana 12:	Temas 3-8. Prácticas 2-6.	Explicar temas. Ejercicios en el aula virtual sobre las clases magistrales y prácticas. Planificación y preparación de trabajo en grupo y seguimiento del aprendizaje en tutoría. Resultados prácticas 1 y 2. Comienzo prácticas 3-5 y resultados de las prácticas.	11.50	12.00	23.50
Semana 13:	Finalización de las prácticas	Resultados de las prácticas. Defensa del trabajo preparado por los alumnos.	11.00	10.00	21.00
Semana 14:		Trabajo autónomo.	0.00	2.00	2.00
Semana 15:		Trabajo autónomo.	0.00	2.00	2.00
Semana 16 a 18:		Trabajo autónomo.	0.00	11.00	11.00
Total			30.00	45.00	75.00