Contenidos teóricos y prácticos de la asignatura
- Profesor: Mariano Hernández Ferrer y Rosa Irene Fregel Lorenzo
- Tema 1: Marcadores moleculares para el estudio de la variabilidad Genética. PCR-RFLP, SCARs, AFLPs, SSR, Haplotipos, SNPs. Características análisis y aplicaciones.
- Tema 2: Conceptos básicos de Genética de Poblaciones. Poblaciones de pequeño tamaño. Pérdida de diversidad genética. Inbreeding. Deriva.
- Tema 3: Metapoblaciones y fragmentación. Estructura poblacional. Efecto Wahlund. Estadísticos F. Diferenciación poblacional. AMOVA. Redes de haplotipos
- Tema 4: Genética y Conservación. Unidades de conservación. Identidad individual. Asignación a poblaciones. Gestión genética de programas de conservación.
- Tema 5: Filogenia Molecular. Alineamiento múltiple de secuencias. Conceptos básicos de filogenia. Monofilia, parafilia y polifilia. Homología, analogía y homoplasia. Genes ortólogos y parálogos.
- Tema 6: Métodos de inferencia filogenética y modelos de evolución. Fiabilidad y contraste de hipótesis filogenéticas. Árboles de distancia: Neighbor-Joining. árboles basados en caracteres: Máxima verosimilitud y bayesiano.
- Profesores: Mariano Hernández Ferrer
Prácticas de laboratorio: Estudio de la diversidad genética en una población natural mediante el uso de microsatélites.
Análisis y aplicaciones.
- Profesor: Mariano Hernández Ferrer y Rosa Irene Fregel Lorenzo
Prácticas de Aula de Informática:
- Alineamiento de secuencias y construcción de árboles filogenético de distancia, máxima verosimilitud y bayesiano.
- Análisis jerárquico de estructura poblacional y flujo génico entre poblaciones. Uso de programas habituaales en este tipo de análisis: DnaSP, GenAlex, ARLEQUIN, Network.
- Tema 1: Marcadores moleculares para el estudio de la variabilidad Genética. PCR-RFLP, SCARs, AFLPs, SSR, Haplotipos, SNPs. Características análisis y aplicaciones.
- Tema 2: Conceptos básicos de Genética de Poblaciones. Poblaciones de pequeño tamaño. Pérdida de diversidad genética. Inbreeding. Deriva.
- Tema 3: Metapoblaciones y fragmentación. Estructura poblacional. Efecto Wahlund. Estadísticos F. Diferenciación poblacional. AMOVA. Redes de haplotipos
- Tema 4: Genética y Conservación. Unidades de conservación. Identidad individual. Asignación a poblaciones. Gestión genética de programas de conservación.
- Tema 5: Filogenia Molecular. Alineamiento múltiple de secuencias. Conceptos básicos de filogenia. Monofilia, parafilia y polifilia. Homología, analogía y homoplasia. Genes ortólogos y parálogos.
- Tema 6: Métodos de inferencia filogenética y modelos de evolución. Fiabilidad y contraste de hipótesis filogenéticas. Árboles de distancia: Neighbor-Joining. árboles basados en caracteres: Máxima verosimilitud y bayesiano.
- Profesores: Mariano Hernández Ferrer
Prácticas de laboratorio: Estudio de la diversidad genética en una población natural mediante el uso de microsatélites.
Análisis y aplicaciones.
- Profesor: Mariano Hernández Ferrer y Rosa Irene Fregel Lorenzo
Prácticas de Aula de Informática:
- Alineamiento de secuencias y construcción de árboles filogenético de distancia, máxima verosimilitud y bayesiano.
- Análisis jerárquico de estructura poblacional y flujo génico entre poblaciones. Uso de programas habituaales en este tipo de análisis: DnaSP, GenAlex, ARLEQUIN, Network.
Actividades a desarrollar en otro idioma
Seminario por parte del Dr. Brent Emerson, IPNA, CSIC.
Para el resto de temas las presentaciones y bibliografía Prof. Mariano Hernández Ferrer y Rosa Irene Fregel Lorenzo
Para el resto de temas las presentaciones y bibliografía Prof. Mariano Hernández Ferrer y Rosa Irene Fregel Lorenzo