Metodologías biomédicas
(Curso Académico 2019 - 2020)

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• CB6 - Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación
• CB7 - Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio
• CB8 - Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios
• CB9 - Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados/no especializados de un modo claro y sin ambigüedades
• CB10 - Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo auto dirigido o autónomo

• CG1 - Adquirir formación avanzada, especializada y multidisciplinar orientada a las tareas de investigación científico técnicas
• CG2 - Adquirir y demostrar conocimientos avanzados aplicables a la investigación científico técnica
• CG3 - Conocer los aspectos teóricos y prácticos de la metodología de trabajo en investigación científico técnica
• CG4 - Saber aplicar e integrar los conocimientos adquiridos para la resolución de problemas de carácter científico técnico
• CG5 - Capacitar para, de forma individual o en grupo innovar metodológica o conceptualmente en el conocimiento científico técnico
• CG6 - Desarrollar autonomía suficiente para participar en proyectos de investigación científico técnicos
• CG7 - Transmitir claramente y sin ambigüedades, a un público especializado o no, los resultados de su trabajo y su potencial transferencia

• CE17 - Comprender la variabilidad biológica
• CE22 - Capacitar para la discusión científica
• CE28 - Abordar experimentalmente problemas concretos de investigación médica
• CE29 - Relacionar un abordaje experimental con las metodologías aplicables
• CE30 - Analizar secuencias genómicas, proteicas y estructurales
• CE31 - Adquirir habilidades técnico-metodológicas para el trabajo en un laboratorio de investigación biomédica
• CE32 - Adquirir capacidad y experiencia para el trabajo en grupo
• CE33 - Manejar fuentes solventes de información científica
• CE34 - Desarrollar capacidad crítica y autocrítica

Módulo 1 - Biología molecular y manipulación genética en animales / Module 1 - Molecular biology and genetic engineering in animals
1.1 ADN recombinante / Recombinant DNA (Dr. Fabián Lorenzo, Área de Genética, ULL).
1.2. Medidas de expresión génica: qPCR, RNAseq, microarrays / Gene expression measurement: qPCR, RNAseq, microarrays (Dr. Diego Alvarez de la Rosa, Área de Fisiología, ULL).
1.3 Silenciamiento de la expresión génica por técnicas de RNA interferente y edición genómica con la tecnología Cas9-CRISPR / Gene expression silencing by interference RNA techniques and genome editing with Cas9-CRISPR technology (Dr. Raimundo Freire, Unidad mixta de Investigación HUC).
Módulo 2 - Estructura de proteínas / Module 2 - DNA cloning and Protein structure
2.1. Expresión y purificación de proteínas / Protein expression and purification (Dr. Fabián Lorenzo, Área de Genética, ULL). .
2.2. Cristalografía de Rayos X / X-ray crystallography (Dra. Cristina Yunta, Evotec UK, Ltd).
2.3 Calorimetría / Calorimetry (Dr. Antonio H. Daranas, Departamento de Química Biológica, IPNA-CSIC).
Módulo 3 - Técnicas analíticas / Module 3 - Analytical Techniques
3.1 Cromatografía de Gases (GC) y Gases Masas (GC-MS); HPLC / Gas (GC) and gas-mass (GC-MS) Chromatography (GC); HPLC (Dr. José Antonio Pérez y Dra. Covadonga Rodríguez González, Dpto. Biología Animal, ULL).
3.2 Lipidómica / Lipidomics (Dr. José Antonio Pérez y Dra. Covadonga Rodríguez González, Dpto. Biología Animal, ULL).
3.3 Biomarcadores / Biomarkers (Dr. Juan Navarro González, Unidad de Investigación HUNSC).
Módulo 4 - Métodos fundamentales en neurociencia / Module 4 - Fundamental methods in neuroscience
4.1 Cirugía estereotáxica en roedores / Stereotactic surgery in rodents (Dr. Pedro Barroso, Área Anatomía, ULL).
4.2 Perfusión de animales de laboratorio / Perfusion of laboratory animals (Dr. Pedro Barroso, Área Anatomía, ULL).
4.3 Hibridación in situ / In situ hybridization (Dres. Ignacio de la Cruz y Domingo Afonso, Área Anatomía, ULL).
4.4 Técnica de PLA / Proximity ligation assay (Dr. Ignacio de la Cruz, Área Anatomía, ULL).
4.5 Técnicas de actividad de transportadores (Uptake) y de receptores (Binding) / Activity assay of transporters (Uptake) and receptor (Binding) (Dr. Domingo Afonso, Área Anatomía, ULL).
Módulo 5- Análisis de conducta en modelos animales de investigación biomédica / Module 5- Behavior analysis in animal models for biomedical research.
5.1 Ratones transgénicos y modelos de enfermedades neurodegenerativas / Transgenic mice and models of neurodegenerative disease (Dr. Daniel Pereda de Pablo, Laboratorio Neurobiología - Señalización celular, ULL).
5.2 Estudio de habilidades motoras y cognitivas con test específicos de conducta / Motor and cognitive skills analysis through conductual specific test (Dr. Daniel Pereda de Pablo, Laboratorio Neurobiología - Señalización celular, ULL).
Módulo 6 - Radiotrazadores en Investigación Biomédica / Module 6- Radiotracers in biomedical research
(Dras. Araceli Delgado Hernández y Carmen Évora García, Ingeniería Química y Tecnología Farmacéutica, ULL).
6.1 Desintegración radiactiva: tipos y cinética / Radioactive decay: types and kinetics
6.2 Interacciones con la materia y detectores de radiación / Interactions with matter and radiation detectors.
6.3 Práctica: Manejo del contador beta y gamma / Practice: Handling the beta and gamma counter.
6.4 Dosimetría y protección radiológica / Dosimetry and radiation protection
6.5 Prácticas: a) Distancia tiempo-blindaje y b) Gestión de residuos / Practices: a) Distance time-shielding and b) Waste management
6.6 Métodos de marcaje / Labeling methods
6.7 Prácticas: marcaje, controles y medidas de muestras radiactivas con el equipamiento disponible en la instalación / Labeling, controls and measurements of radioactive samples



 

Todo el material audiovisual utilizado en el curso estará en el idioma inglés. Además de la bibliografía básica, se proporcionará a los alumnos a través del aula virtual artículos especializados en idioma inglés, cuya lectura formará parte del trabajo autónomo de los estudiantes.
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The audio-visual material used in the course will be in English. Besides the basic bibliography, students will be provided with specialized articles in English, through the virtual classroom. Reading these articles will be part of the independent work of the students.

El trabajo del alumnado consistirá en una combinación de estudio autónomo a partir del material proporcionado en el aula virtual con los seminarios teóricos y de trabajo práctico durante las sesiones presenciales. Algunas secciones de la asignatura serán impartidas o ampliadas por profesores visitantes, especialistas en el campo de que se trate. A través del material didáctico disponible en el aula virtual, se identificarán para el alumnado conceptos previos que se precisan para la comprensión del temario y que deben ser estudiados de forma autónoma.
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The students' work will consist of a combination of self-study of the material provided in the virtual classroom and the theoretical seminars and practical lessons. Some sections of the course will be imparted by visiting professors, specialists in the field. The students will have available teaching material in the virtual classroom that should be studied autonomously.

Actividades formativas	Horas presenciales	Horas de trabajo autónomo	Total horas	Relación con competencias
Clases teóricas	14,00	60,00	74,0	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB8], [CB7]
Clases prácticas (aula / sala de demostraciones / prácticas laboratorio)	44,00	12,00	56,0	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB8], [CB7]
Realización de seminarios u otras actividades complementarias	0,00	10,00	10,0	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB8], [CB7]
Realización de exámenes	2,00	0,00	2,0	[CB8]
Asistencia a tutorías	7,00	1,00	8,0	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB8], [CB7]
Total horas
Total ECTS

1. Alberts B, Bray D, Hopkin K, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. 2006.
Introducción a la Biología Celular, 2ª edn. Editorial Médica Panamericana. Madrid.
2. James D Watson et al, Biología Molecular del Gen 5ª edición, Editorial Médica Panamericana 2006
3. Carl Branden, John Tooze., Branden, Carl., Introduction to protein structure. 2nd. ed. Garland Publishing Inc. 
4. Gopal B. Saha. (2018). Fundamentals of Nuclear Pharmacy. 7ª ed., Editorial Springer International Publishing. e-book disponible a través del Punto Q.  
https://link.springer.com/book/10.1007%2F978-3-319-57580-3
 

Mello CC, Conte D Jr.  Revealing the world of RNA interference. Nature. 2004 Sep 16;431(7006):338-42. PMID: 15372040
Wang H, La Russa M, Qi LS. CRISPR/Cas9 in Genome Editing and Beyond. Annu Rev Biochem. 2016 Jun 2;85:227-64. doi: 10.1146/annurev-biochem-060815-014607. PMID: 27145843
Application of isothermal titration calorimetry as a tool to study natural product interactions. O. Callies  and  A. Hernández Daranas. 
Nat. Prod. Rep.
, 2016,33, 881-904. DOI: 10.1039/C5NP00094G

Se facilitará a los alumnos artículos concretos sobre cada una de las técnicas reseñadas. Dado que se tiende a elegir los artículos más recientes sobre cada técnica, éstos se seleccionan con poca antelación respecto al inicio del curso.
Students will have access to specific scientific articles describing all the biomedical technologies mentioned in the course. Such references will be selected from the recent literature available at that moment.
 

https://www.tainstruments.com/applications-library-search/

Evaluación continua (60%). Se utilizarán cuatro criterios en la evaluación:
1. Asistencia (5%): dado el contenido eminentemente práctico es esencial la asistencia a, al menos, el 80% de las sesiones presenciales para superar la asignatura.
2. Cuestionario electrónico sobre trabajos de investigación (10%). El cuestionario electrónico consistirá en una ficha con formato predeterminado que tendrá que rellenar cada estudiante individualmente basándose en la lectura de un artículo de investigación de su elección. El contenido de la ficha a rellenar es el siguiente:
   •    Antecedentes (máximo 150 palabras);
   •    Objetivo (¿qué pregunta pretende responder el artículo?) (máximo 50 palabras);
   •    Breve descripción de la metodología utilizada (máximo 150 palabras);
   •    ¿Qué limitaciones tiene dicha metodología? (máximo 100 palabras);
   •    ¿Qué aproximaciones/técnicas alternativas podrían haberse utilizado? (máximo 150 palabras).
3. Exposición oral (15%). Consiste en preparar una presentación sobre un trabajo/artículo científico y exponerlo en público, haciendo énfasis en la aproximación metodológica empleada.
4. Prácticas de laboratorio (30%): El alumno tendrá que realizar las prácticas planteadas en los diferentes módulos de la asignatura, atendiendo a la resolución de los problemas planteados. El desarrollo de las mismas es de obligado cumplimiento para superar la asignatura.
 
Evaluación única (40%). Examen teórico de tipo test (respuesta múltiple) atendiendo al contenido de la asignatura. Para superar dicho examen el alumno tendrá que obtener un mínimo de 5 puntos sobre 10.

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Continual Assessment (60%). Four criteria will be used in the evaluation:
1. Attendance (5%): Due the eminently practical content of the subject, it is essential to attend to, at least, 80% of the lessons.
2. Electronic Questionnaire about research articles (10%): Each student will have to fill in individually an electronic questionnaire file, after reading a research paper. The content to fill in the file is:
   •    Background (maximum 150 words);
   •    Objective (what question does the paper want to answer?) (Maximum 50 words);
   •    Brief description of the methodology used (maximum 150 words);
   •    What limitations does the methodology have? (Maximum 100 words);
   •    Which approaches or alternative techniques could have been used? (Maximum 150 words)
3. Oral presentation (15%): Based on a research article proposed by the teachers, the students will prepare a presentation and expose it in public, emphasizing the methodological approach used.
4. Laboratory practices (30%): The student will have to carry out the practices proposed in the different modules of the subject, and try to solve the proposed exercises. The development of the same is mandatory to overcome the subject.

Single assessment (40%). Theoretical exam: A test according to the content of the subject. To pass the exam the students must have a mark of, at least, 5 over 10.

 

Tipo de prueba	Competencias	Criterios	Ponderación
Pruebas objetivas	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB7], [CB8]	En la exposición oral se valorará: 1. Respetar el límite de tiempo establecido para la exposición (10%) 2. La claridad en la exposición del problema (30%) 3. La concreción de la propuesta experimental (30%) 4. Las respuestas a las preguntas realizadas (30%)	15,00 %
Pruebas de respuesta corta	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB7], [CB8]	En el exámen teórico se valorará: 1. El número de respuesta correctas acertadas: máxima puntuación si responde al total de respuestas válidas por pregunta, 50% o 25% de la puntuación si responde 2/3 o 1/3 de las respuestas válidas, respectivamente. 2. El número de fallos cometidos: tres preguntas respondidas de manera incorrecta anularán una pregunta válida.	40,00 %
Trabajos y proyectos	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB7], [CB8]	En el trabajo escrito se valorará: 1. Respetar el límite de espacio establecido para la redacción de cada respuesta (20%) 2. La concreción de la respuesta respecto a lo preguntado (40%) 3. La adecuación de la respuesta respecto a lo preguntado (40%)	10,00 %
Pruebas de ejecuciones de tareas reales y/o simuladas	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB7], [CB8]	Las prácticas de laboratorio se valorarán: 1. Habilidades de ejecución (40%) 2. Claridad y concreción en la elaboración de informes (30%) 3. Respuestas a las preguntas realizadas (30%)	30,00 %
Asistencia a clase	[CB6], [CB9 ], [CB10 ], [CG1], [CG2], [CG3], [CG4], [CG5], [CG6], [CG7], [CE17], [CE22], [CE28], [CE29], [CE30], [CE31], [CE32], [CE33], [CE34], [CB7], [CB8]	Para la obtención de la nota numérica se establece una proporción, donde el total de asistencias posibles equivale a la máxima puntuación, y desciende de forma lineal hasta 0 puntos.	5,00 %

* La distribución de los temas por semana es orientativo, puede sufrir cambios según las necesidades de organización docente. / The per-week distribution of chapters is orientative, as it can be changed depending on teacher’s organization.

Semana	Temas	Actividades de enseñanza aprendizaje	Horas de trabajo presencial	Horas de trabajo autónomo	Total
Semana 1:	Módulo 1 - Biología molecular y manipulación genética en animales	Seminarios teóricos y sesiones prácticas sobre los contenidos del módulo	10.00	12.50	22.50
Semana 2:	Módulo 2 - Clonaje de ADN y Estructura de proteínas	Seminarios teóricos y sesiones prácticas sobre los contenidos del módulo	10.00	12.50	22.50
Semana 3:	Módulo 3 - Técnicas analíticas	Seminarios teóricos y sesiones prácticas sobre los contenidos del módulo	10.00	12.50	22.50
Semana 4:	Módulo 4 - Métodos fundamentales en neurociencia	Seminarios teóricos y sesiones prácticas sobre los contenidos del módulo	10.00	12.50	22.50
Semana 5:	Módulo 5 - Análisis de conducta en modelos animales de investigación biomédica	Seminarios teóricos y sesiones prácticas sobre los contenidos del módulo	10.00	20.00	30.00
Semana 6:	Módulo 6 - Radiotrazadores en investigación biomédica	Seminarios teóricos y sesiones prácticas sobre los contenidos del módulo. Realización de examen final	10.00	20.00	30.00
Total			60.00	90.00	150.00