Le coordinateur du programme sera désigné par le Comité académique parmi les deux représentants de l'Université de Saragosse et en assurera la présidence. Les deux membres du Comité académique de chaque université seront désignés d'un commun accord entre les recteurs des universités participantes (article 8.4 du Décret royal 99/2011).

Chaque université non coordinatrice désignera un coordinateur spécifique parmi les deux membres du Comité académique. Ce coordinateur présidera le Comité académique local correspondant, désigné par chaque université participante. Ce comité sera composé des deux membres de l'université qui en font partie. Il sera constitué conformément à la législation en vigueur.

Le comité académique du programme assignera un mentor à chaque doctorant admis au programme. Ce mentor coordonnera les interactions avec le comité académique du programme. Le mentor doit être un médecin possédant une expérience avérée en recherche. Une expérience avérée est définie comme la satisfaction de l'une des conditions suivantes :

a) Avoir deux périodes de recherche de six ans, la dernière en vie,

b) Avoir trois périodes de recherche de six ans,

c) Être le PI d'un projet du Plan National ou Autonome,

d) Avoir dirigé au moins une thèse de doctorat notée « cum laude » à l’unanimité,

e) Avoir un brevet,

f) Avoir au moins 5 publications au cours des 6 dernières années, dont trois doivent être dans des revues JCR.

Le comité académique du programme assignera un directeur de thèse à chaque doctorant dans un délai maximum de six mois après l'inscription initiale. Le directeur de thèse est responsable de la cohérence et de la pertinence de la formation à la recherche et des compétences transversales du doctorant.

En règle générale, le directeur de thèse sera un professeur ou un chercheur de l'une des universités participantes, titulaire d'un doctorat et justifiant d'une expérience avérée en recherche, comme c'est le cas pour le tuteur. Cependant, l'inclusion de titulaires de doctorat issus d'entités affiliées aux différentes universités participantes, ainsi que d'instituts de recherche, comme codirecteurs de thèse sera facilitée, conformément aux accords de collaboration et d'affiliation respectifs. La codirection par deux professeurs sera encouragée : l'un de l'université d'origine de l'étudiant, justifiant d'une expérience avérée en recherche, et l'autre, quelle que soit l'université, ne devant pas remplir les conditions ci-dessus. Cela facilitera l'accès à l'encadrement de thèses de doctorat pour les jeunes chercheurs sans expérience préalable, qui pourront co-encadrer avec un chercheur possédant une solide expérience en encadrement de thèses de doctorat.

Si un chercheur du secteur des affaires participe en tant que codirecteur d'une thèse de doctorat, les exigences d'expérience de recherche accréditée susmentionnées ne seront pas requises.

Au sein des comités de thèse, la participation d'experts internationaux sera encouragée, comme c'est déjà le cas dans les programmes de doctorat actuellement proposés par les universités participantes. Plus précisément, la préparation de thèses avec un diplôme de doctorat international sera encouragée, ce qui exige déjà la demande obligatoire de deux rapports d'experts internationaux pour l'évaluation de la thèse et la présence d'un expert étranger au sein du comité. À noter que cette pratique est déjà en vigueur (voir la liste des thèses soumises à la section 6 pour un exemple).