La biblioteca de Javier Muguerza fue donada, junto con el archivo, a la Biblioteca de la Universidad de La Laguna  por él y Concepción López Noguera en 2018.

La biblioteca contiene unas 9000 obras, muchas de ellas dedicadas, con libros de Fondo Antiguo (17 obras). Acompaña a la biblioteca una hemeroteca formada por 487 títulos de publicaciones periódicas, una colección de separatas y folletos, así como tesis doctorales, incluida la suya, las que él dirigió y aquellas en las que participó como miembro del tribunal que las evaluó.

Se trata de un fondo multidisciplinar que refleja la riqueza y el alcance de los autores y temas que le interesaron a lo largo de su actividad investigadora y académica. El fondo incluye la totalidad de la obra de creación publicada por Javier Muguerza Carpintier.

Localización: Sala de Legados (planta 1ª) de la Biblioteca General y de Humanidades del Campus de Guajara.