Le programme de doctorat en chimie et génie chimique suit les directives de l'article 11, Encadrement et suivi des doctorants, du décret royal 99/2011 et du Règlement officiel des études doctorales de l'ULL, qui, dans ses articles 14, 15 et 16, décrit la composition du comité académique du programme doctoral et ses fonctions, qui incluent l'encadrement et le suivi des doctorants pendant leur formation doctorale. Le comité académique du programme doctoral officiel sera composé de six personnes : quatre professeurs et/ou chercheurs correspondant à chaque axe de recherche du programme doctoral, un professeur/chercheur membre du comité de qualité qui assurera le secrétariat, et le coordinateur académique, qui assurera la présidence et qui répond aux exigences du décret royal et du règlement de l'ULL.

De même, l'article 23 du Règlement décrit les procédures établies par le programme doctoral pour l'encadrement et le suivi des doctorants durant leur formation doctorale. Outre l'affectation d'un tuteur, les délais fixés pour cette affectation et la procédure de modification de cette affectation, conformément à l'article 10 du Règlement de l'ULL, points 5, 6 et 7, le Comité académique du programme doctoral veillera à une répartition appropriée et proportionnée des doctorants entre les axes de recherche composant le programme doctoral et leurs directeurs de thèse, en établissant une série de limitations afin d'éviter l'accumulation de travaux sous un axe et une direction uniques, un allongement excessif de la durée de la thèse pour des raisons indépendantes de la volonté des étudiants, ou l'absence de publications basées sur les résultats de la thèse.

Concernant la procédure de suivi du carnet d'activité de chaque doctorant et de certification de ses données, le programme propose, selon l'activité de formation concernée, que le tuteur ou le directeur, ou, le cas échéant, les deux, collectent ces informations et les soumettent au comité académique du programme pour certification. Conformément à l'article 15 du règlement de l'ULL, ce comité est chargé d'évaluer chaque année, dans les délais impartis, le plan de recherche et le plan de formation contenus dans le document d'activité de chaque doctorant. Ce comité doit également approuver les séjours prévus des doctorants dans d'autres centres nationaux et internationaux, les cotutelles et les mentions européennes, conformément à la procédure de demande de mention internationale pour une thèse de doctorat à l'ULL.