Nació en San Cristóbal de La Laguna, hijo de Juan Núñez de la Peña, natural de Tenerife, y María Solís, natural de Córdoba. Estudió en el colegio de San Agustín de La Laguna y recibió órdenes menores en 1659. Ejerció de escribano público en Toledo, donde vivió durante cierto tiempo. La obra que marcó su trayectoria como historiador fue Conquista y antigüedades de las islas de la Gran Canaria y su descripción, con muchas advertencias de sus privilegios, conquistadores, pobladores y otras particularidades en la muy poderosa isla de Tenerife, dirigido a la milagrosa imagen de Nuestra Señora de Candelaria. Su aparición en 1676 constituye una referencia en la historiografía canaria. La preparación de esta obra lo llevó a investigar documentos municipales, notariales y eclesiásticos, de donde surge su interés por la genealogía del Archipiélago. Realizó, incluso, genealogías por encargo.
Genealogía en Canarias

Los inicios de la Genealogía en Canarias: Juan Núñez de la Peña (1641–1721)
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[Firma de Nuñez de la Peña] En: ÁLVAREZ RIXO, J. A. Caligrafia de Nuñez de la Peña. [Manuscrito]. [Puerto de la Cruz], [1849].
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ÁLVAREZ RIXO, J. A. Caligrafia de Nuñez de la Peña. [Manuscrito]. [Puerto de la Cruz], [1849].
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Árbol genealógico de Juan Núñez de la Peña
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Árbol genealógico de Juan Núñez de la Peña





