Durante su etapa como profesor de Filosofía e Historia de la Ciencia en la Universidad de La Laguna hasta su jubilación en 2015, Jesús Sánchez Navarro ocupó varios cargos académicos: Director del Departamento de Historia y Filosofía de la Ciencia, la Educación y el Lenguaje (1988-1990), Secretario (1995-1996), Vicedecano (1996-1998) y Decano de la Facultad de Filosofía (1998-2001). 

Dirigió numerosas tesis y tesinas y fue investigador principal en diferentes proyectos nacionales e internacionales. Realizó parte de su actividad investigadora con los profesores K. Mulligan (Universidad de Ginebra, 1989), E. Agazzi  (Universidad de Friburgo, Suiza, 1989), S. Barry Barnes (Universidad de Edimburgo, 1990), R. Harré (Universidad de Oxford, 1990), E.P. Bos (Universidad de Leiden, 1992) y en el Department of History and Philosophy of Science (Universidad de Cambridge, 1996).

Fue subdirector de la revista Gavagai y miembro del consejo editor de la revista Laguna, así como uno de los cofundadores y  coordinador de investigación del Seminario Orotava de Historia de la Ciencia (1992-1998). También fue miembro de varios comités científicos nacionales e internacionales, como: Philosophy of Science Association, History Science Society,  British Society for the History of Science, Sociedad española de Lógica, Metodología y Filosofía de la Ciencia o la Sociedad Española de Historia de la Ciencia y de las Técnicas (SEHCYT).

Publicó y fue editor y coordinador de múltiples obras colectivas y  revistas científicas. Entre sus monografías cabe destacar Hacia un nuevo empirismo (2003) y Huellas de una ciencia creativa (2003). Entre sus  artículos merecen nombrarse: “Hacia una teoría pragmática de la ciencia: modelos, intereses y tecnología” (1985), “El sistema ptolemaico” (1992), “La sociología y la naturaleza social de la ciencia” (1995) y “Canarias y la historia de la Ciencia” (2001).

Además, hay que reseñar por su interés para la investigación la existencia de los siguientes trabajos inéditos conservados en su Archivo personal: La matemática:¿es un producto social? (1999); Hechos, valores y cambio científico: la determinación de la longitud y el meridiano de referencia (2004) y De la perspectiva a la anatomía: arte, ciencia y valores en los inicios de la Revolución Científica (2004).

Entre sus actividades académicas cabría resaltar la traducción de la obra de I. Hacking, ¿La construcción social de qué? (2001).

Una cualidad que caracterizaba al profesor Jesús Sánchez a lo largo de su trayectoria en esta Universidad fue su pasión por el conocimiento, más allá de un interés por la Filosofía. Esta pasión se manifestaba en su forma entusiasta de transmitir sus saberes al estudiantado, tanto en las aulas como fuera de ellas, así como en su labor investigadora y divulgadora, que lo llevó a participar en múltiples congresos, seminarios, conferencias y cursos impartidos en nuestras islas y fuera de ellas, dirigidos a la comunidad universitaria y, también, al profesorado de Enseñanzas Medias.

Una faceta importante de su actividad universitaria fue su generosa colaboración con la Biblioteca comprometiéndose con el desarrollo de la colección del fondo de Filosofía, entre otras actividades. Cabe destacar su participación en la celebración del Día del Libro de 2003, formando parte del equipo que comisarió la exposición y que redactó los textos del catálogo Huellas de una ciencia creativa: la Química en el Fondo Histórico de la Biblioteca de la Universidad de La Laguna (Nota de prensa). 

Coincidiendo con su jubilación, y en el marco de los actos de la exposición A la luz del conocimiento: la luz y sus aplicaciones (2015), impartió una conferencia magistral dedicada a la figura de Nikola Tesla.  Este acto, organizado por el Club de Lectura de la biblioteca de la Universidad de La Laguna, constituyó su última lección académica.

Con la donación de su biblioteca personal a esta institución, y gracias a la intermediación de su esposa Asunción Asin Cabrera, se cumplió uno de sus mayores deseos: que su biblioteca privada formara parte del patrimonio bibliográfico de la Universidad de La Laguna.  

En la actualidad esta donación se encuentra disponible y accesible a través del Catálogo de la Biblioteca de la Universidad de La Laguna.