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CTM2016-80095-C2-2-R. Nouvelles approches pour l'exploration des interactions microbiennes dans les communautés marines (NOVAMAR)

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Les océans constituent le plus vaste écosystème terrestre, tout en étant l'un des moins bien compris. L'activité des micro-organismes marins régule les cycles biogéochimiques et exerce une influence considérable sur le climat. L'activité humaine a un impact important sur les océans et, inversement, dépend fortement de leurs ressources. Dans des projets antérieurs, nous avons utilisé de nouvelles technologies de séquençage pour décrire les communautés de bactérioplancton. Nous nous sommes concentrés sur les Bacteroidetes, car ils représentent une part importante des communautés marines. En travaillant avec des cultures représentatives de ce groupe taxonomique, nous avons réalisé des progrès significatifs dans la compréhension de la physiologie des organismes marins qui utilisent la matière organique et la lumière pour leur croissance. Nos études, ainsi que celles d'autres chercheurs, nous ont permis d'élaborer un modèle décrivant le rôle des Bacteroidetes dans le milieu marin. Ce groupe semble être adapté, entre autres, à la croissance sur les polysaccharides et les peptides, à l'utilisation de facteurs de croissance à faible concentration, à l'adhésion aux particules et à la production d'énergie à partir de la lumière. Forts de ces informations, nous pensons que notre prochaine étape consistera à étudier les interactions et les adaptations des Bacteroidetes dans les océans. Nous nous concentrerons sur l'expression des gènes caractéristiques de la fonction des Bacteroidetes en milieu marin. Les types d'interactions entre les groupes taxonomiques au sein des Bacteroidetes et d'autres composantes du bactérioplancton seront également étudiés. Notre objectif pour cette dernière recherche sera d'identifier les gènes ou groupes de gènes contigus qui favorisent ces interactions.

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Les océans constituent le plus vaste écosystème de la planète et pourtant l'un des moins connus. L'activité des micro-organismes marins est à l'origine des cycles biogéochimiques et régule le climat. De plus, l'activité humaine a un impact considérable sur les océans, tout en dépendant fortement de leurs ressources. Dans des projets antérieurs, nous avons utilisé les technologies de séquençage d'acides nucléiques les plus récentes pour décrire le bactérioplancton océanique. Nous nous sommes concentrés sur les Bacteroidetes, car ils représentent l'une des principales composantes des communautés marines. Grâce à des cultures représentatives, nous avons progressé dans la compréhension des adaptations de ce groupe taxonomique aux conditions océaniques. Nous avons notamment étudié l'effet de la lumière sur les Bacteroidetes marins se développant sur de la matière organique. À partir des informations que nous avons recueillies et de celles d'autres équipes de recherche, nous avons élaboré un organisme modèle général adapté à l'adhésion aux particules, à la dégradation des polysaccharides ou des peptides pour sa croissance et à l'absorption de facteurs de croissance à faible concentration. Nous pensons que notre prochaine étape consiste à exploiter ces informations pour répondre à des questions clés concernant le rôle des Bacteroidetes dans le milieu marin. Nous prévoyons d'étudier les interactions entre les membres du phylum Bacteroidetes et avec ceux situés sur d'autres branches de l'arbre phylogénétique. Notre objectif est d'identifier les gènes et les groupes de gènes qui favorisent ces interactions.

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Chercheur à l'Université de La Laguna