• Microscopía convencional de fluorescencia.
• Microscopía de superresolución (STED y dSTORM)
• Detección de marcajes inmunocitoquímicos mediante anticuerpos marcados con fluorocromos tanto en cultivos celulares como en cortes histológicos.
• Hibridación in situ con sondas fluorescentes (FISH)
• Obtención de micromuestras a partir de cortes histológicos mediante microdisección láser. 
• Análisis de células in vivo y a tiempo real mediante marcadores y/o proteínas de fusión fluorescentes y derivados, en condiciones de temperatura y atmósfera controladas.
• Estudios de colocalización, de internalización y tráfico intracelular. 
• Análisis fisiológico de respuesta de Ca2+.
• Estudio de interacciones entre proteínas mediante la técnica FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfer)
• Estudio de transporte de proteínas mediante la técnica FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching)
• Determinación de espectros de fluorescencia (Lambda Scan) 
• Tratamiento de imágenes y cuantificación con programas especializados: LAS X, Huygens Deconvolution, ImageJ/ Fiji.

Asimismo, el SIMA realiza otras tareas como:

• Mantenimiento y coordinación del uso de los distintos microscopios propios del Servicio. 
• Soporte técnico en el uso de los microscopios y software de procesamiento de imagen para personal no formado. 
• Formación obligatoria para usuarios en régimen autónomo.
• Asesoramiento y soporte técnico a los usuarios. 
• Realización de procedimientos experimentales. 
• Preparación de muestras.

MICROSCOPIO CONFOCAL OLYMPUS FV1000:

• Microscopio invertido Olympus IX81, con pletina XY motorizada.
• 3 PMTs (detectores fotomultiplicadores)
• 1 detector de luz transmitida.
• Lámpara de mercurio para fluorescencia.
• Cámara de incubación con control de temperatura y C02 para célula viva.
• Objetivos: 10X/0.3 NA, 20X/0.75 NA, 40X/1.30 NA y 60 X/1.35 NA.
• Filtros de fluorescencia para DAPI, FITC y TRITC.
• Líneas de láser: diodo láser de 405 nm, láser de Argón multilínea 458/488/514 nm, láser de Helio Neón verde de 543 nm, y láser de Helio Neón rojo de 633 nm.
• Sistema de barrido de 4096×4096.
• Velocidad de barrido de 4fps en 512×512. 

MICROSCOPIO DIRECTO DE EPIFLUORESCENCIA LEICA DM 4000B:

• Objetivos 5X/0.15 NA, 10X/0.30 NA, 20X/0.5 NA, 40X/0.75 NA y 100X/1.30 NA para inmersión en aceite.
• Software para análisis de imagen Q-Win y Q-fluoro. 

MICROSCOPIO CONFOCAL LEICA TCS SP8:

• Microscopio invertido DM6000, con platina XY motorizada y pletina galvanométrica en Z.
• 4 detectores: 2 PMT fotomultiplicadores y 2 híbridos del tipo HyD (PMT+GaAsP)
• 1 detector de luz transmitida.
• Lámpara de haluros metálicos para fluorescencia.
• Cámara de incubación con control de temperatura y C02 para célula viva.
• Objetivos: 10X/0.40 NA, 20X/0.70 NA, 40X/0.85 NA, 40X/1.30 NA, y 63X/1.40 NA.
• Filtros de fluorescencia para DAPI, FITC y TRITC. 
• Líneas de láser: diodo láser de 405 nm, láser de Argón multilínea 458/488/514 nm, diodo láser de 561 nm y láser de Helio Neón rojo de 633 nm. 
• Sistema de barrido de alta resolución de 8192×8192; (x) velocidad de barrido de 4fps en 512×512.
• Software LAS AF con módulos para colocalización FRET y FRAP. 

SISTEMA DE MICROSCOPÍA DE SUPERRESOLUCIÓN POR AGOTAMIENTO DE EMISIÓN ESTIMULADA (STED) ACOPLADA AL MICROSCOPIO TCS SP8:

• 2 láser de STED de alta potencia (>1,5 W) de longitud de onda de 592 nm y de 660 nm, para depleción.
• Acoplamiento óptico mediante ultra-precisa fibra óptica con “Votex phase filter” y polarización óptica para mejora de resolución, optimización de cero PSF.
• Rack que integra láser de STED, control electrónico y modulación óptica (AOTF) 
• Integración en el software del confocal LAS X.
• Implementación de software de deconvolución con algoritmos especialmente dedicados a imágenes STED.
• Paquete de software deconvolución, visualización y análisis para imágenes STED y confocal.
• Objetivo optimizado para aplicaciones STED, PLAN APO 100x/1,40 aceite STED White.
• Módulo 3D STED. 
• Mesa antivibratoria activa. 
• Mesa óptica activa. 

UNIDAD DE MICROSCOPÍA DE REFLEXIÓN INTERNA TOTAL (TIRF) ACOPLADA A ELECTROFISIOLOGÍA Y ESPECTROSCOPIA.

• Sistema completo de electrofisiología (patch-clamp. Axon/Molecular Devices) acoplado a microscopio TiU equipado con módulo TIRF, sistema DMD, Iluminación LED SpectraX (Lumencor) con juegos de filtros para todas las longitudes de onda disponibles en torretas de filtros motorizadas.
• Sistema de imagen compuesto de cámara EMCCD Andor IXON, acoplado a un espectrógrafo ACTON con rejillas de difracción y espejo. 
• Interfase NiDAQ, software MicroManager y NIS-Elements (NIKON)
• Sistema acoplado a dos posibles equipos de perfusión, uno ultra-rápido (multichannel systems) y otro convencional (ALA systems)

SISTEMA DE MICRODISECCIÓN POR LÁSER LEICA AS LMD. 

• Equipo completo estándar para la realización de microdisección de captura láser para aislar regiones o células de interés.

• Normas del Servicio de Microscopía