El ITB tiene por objeto el desarrollo y potenciación de la investigación biomédica de excelencia, con orientación traslacional y en relación con las necesidades biosanitarias de su entorno social. La misión del ITB puede sintetizarse en la combinación de enfoques interdisciplinares de la biomedicina básica, la química medicinal y la investigación clínica, dirigida hacia el descubrimiento de nuevas aproximaciones que faciliten la transferencia de conocimiento y tecnología biosanitaria a los pacientes y la industria.
Desde sus inicios, el ITB se planteó entre sus objetivos estructurales el establecimiento de sinergias entre las diferentes entidades regionales dedicadas a la investigación biosanitaria, con la finalidad de consolidar en Canarias un espacio para la investigación biomédica competitiva, sostenible y con vocación de excelencia. Para ello, entre otras iniciativas, ha promovido la elaboración de planes estratégicos plurianuales y la participación, junto con otros institutos y centros de investigación regionales, en convocatorias públicas nacionales y europeas para la financiación de proyectos comunes de investigación y adquisición de grandes equipos científicos.